本系由系友捐贈或募款經費設立相關獎學金。
本校亦有校內外各類獎助學金可供申請，
相關資訊請至學務處生活輔導組 > 獎助學金專區 查詢最新資料。
研究生在學期間除每學期之研究生獎學金及助教獎（助）學金外，另可享有本系專設之新生獎學金及書卷獎。
此外，研究生也可以參與教授之研究計劃，其個人津貼視計劃案內容而定。
本系提供下列獎學金供研究所學生申請：
淡江大學數學學系專業證照獎勵
淡江大學數學學系參加校外專業技能及體育競賽獎勵要點
淡江大學數學學系碩士班書卷獎獎學金
系上主動通知，無需申請
淡江大學數學學系碩士班研究生入學獎學金
無需申請
淡江大學數學學系大學部預研生修讀學、碩士學位獎學金
參閱預研生修讀規則，無需申請
淡江大學數學學系深耕經濟不利學生獎助學金